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文章詳情

基于深度卷積生成對抗網(wǎng)絡(luò)和近紅外高光譜成像技術(shù)對不健康小麥籽粒識別

日期:2024-11-22 18:58
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摘要:中國農(nóng)業(yè)大學(xué)吉海彥教授團(tuán)隊(duì)利用GaiaSorter推掃式高光譜成像系統(tǒng)(江蘇雙利合譜公司)(圖1)獲取了健康、發(fā)芽、霉變和萎蔫小麥籽粒的高光譜影像。

背景:

實(shí)際生產(chǎn)過程中,經(jīng)常發(fā)現(xiàn)健康小麥籽粒中混雜著損壞的、發(fā)芽的、霉變的和感染萎蔫病的籽粒。受損的麥粒失去了生存能力,發(fā)芽和霉變的麥粒沒有育種價值。因此,區(qū)分健康與不健康麥粒對于育種具有重要意義。近年來,將高光譜成像技術(shù)與機(jī)器學(xué)習(xí)、深度學(xué)習(xí)相結(jié)合的方法在種子識別領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。但在實(shí)際應(yīng)用中,處于不健康狀態(tài)的麥粒數(shù)量有限,導(dǎo)致數(shù)據(jù)量少或數(shù)據(jù)分布不平衡。此外,數(shù)據(jù)量較小的類別很容易被數(shù)據(jù)量較大的類別所忽略。因此,基于數(shù)據(jù)驅(qū)動的機(jī)器學(xué)習(xí)或深度學(xué)習(xí)算法的準(zhǔn)確率較低。

這些問題應(yīng)該從根本上通過增加訓(xùn)練數(shù)據(jù)來解決,即從原始數(shù)據(jù)中產(chǎn)生更多的數(shù)據(jù)。生成對抗網(wǎng)絡(luò)(Generative adversarial network, GAN)是一種深度學(xué)習(xí)模型,可用于學(xué)習(xí)原始數(shù)據(jù)的復(fù)雜分布。采用深度卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(Deep convolutional neural networks, DCNN)結(jié)合GAN增強(qiáng)高光譜訓(xùn)練樣本并建立模型。DCNN分類器與GAN結(jié)合使用的準(zhǔn)確率為95.32%,未結(jié)合的準(zhǔn)確率為92.94%。由此可見其方法的優(yōu)越性。然而,在種子識別領(lǐng)域,GAN幾乎從未被用于生成數(shù)據(jù)以提高分類器的性能。為此,本文提出了一種基于深度卷積對抗生成網(wǎng)絡(luò)(Deep convolutional generative adversarial networks, DCGAN)的數(shù)據(jù)增強(qiáng)方法。然后采用決策樹(DT)、支持向量機(jī)(SVM)和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)相結(jié)合的高光譜成像技術(shù)對小麥健康和不健康籽粒進(jìn)行識別。

本文的主要目標(biāo)是:(1)評估基于DCGAN的生成樣本的質(zhì)量;(2)比較擴(kuò)展不平衡數(shù)據(jù)集前后不同分類算法的性能;(3)在上一步的基礎(chǔ)上,通過DCGAN增加訓(xùn)練樣本,評估不同分類算法的準(zhǔn)確率是否可以進(jìn)一步提高;(4)評價訓(xùn)練樣本數(shù)量的變化對各分類器分類性能的影響。

試驗(yàn)設(shè)計(jì)

中國農(nóng)業(yè)大學(xué)吉海彥教授團(tuán)隊(duì)利用GaiaSorter推掃式高光譜成像系統(tǒng)(江蘇雙利合譜公司)(圖1)獲取了健康、發(fā)芽、霉變和萎蔫小麥籽粒的高光譜影像。光譜范圍為866.4 - 1701.0 nm。四種籽粒分別獲取了100、82、91和74個樣本。

圖1 高光譜系統(tǒng)結(jié)構(gòu)

GAN是由生成器(Generator)和判別器(Discriminator)兩個部分組成(圖2)。生成器接收隨機(jī)噪聲,通過生成模型生成假樣本。判別器的輸入是一個樣本,判別網(wǎng)絡(luò)判斷輸入樣本是來自于真實(shí)樣本還是生成器生成的假樣本。通過不斷訓(xùn)練,生成器*終生成盡可能真實(shí)的數(shù)據(jù)。本研究采用DCGAN作為增強(qiáng)數(shù)據(jù)的方法。DCGAN主要的改進(jìn)是在網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)上,生成器和判別器中均使用了一個卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),同時改進(jìn)了卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)部分結(jié)構(gòu)(圖3)。

GAN生成的光譜數(shù)據(jù)的質(zhì)量評估主要分為兩個方面,一是生成的光譜與真實(shí)光譜的相似度,二是生成的光譜的多樣性。光譜的相似度主要從三個方面進(jìn)行評價。一方面,計(jì)算生成的光譜數(shù)據(jù)與真實(shí)光譜數(shù)據(jù)之間的均方根誤差(RMSE),其次,通過對不同時期生成的光譜進(jìn)行可視化,觀察其與真實(shí)光譜的差異,*后,利用主成分分析(PCA)對生成數(shù)據(jù)與真實(shí)數(shù)據(jù)進(jìn)行降維,觀察其主成分分布范圍,判斷生成數(shù)據(jù)與真實(shí)數(shù)據(jù)的相似度。

本研究使用的三種分類算法為決策樹(DT)、支持向量機(jī)(SVM)和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)。試驗(yàn)分為兩個階段,**階段,將不平衡的小麥籽粒數(shù)據(jù)集擴(kuò)展到平衡狀態(tài)后,記錄變化前后測試集的準(zhǔn)確率,判斷基于DCGAN的數(shù)據(jù)增強(qiáng)方法是否有效。**階段是在**階段試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,將生成的光譜數(shù)據(jù)加入到平衡的小麥籽粒數(shù)據(jù)集中,增加訓(xùn)練集的數(shù)量,從而判斷數(shù)據(jù)增強(qiáng)對模型性能的影響。

圖2 GAN結(jié)構(gòu)

圖3 DCGAN結(jié)構(gòu)

結(jié)論

從圖4可以看出,4種小麥籽粒的光譜特征相似,萎蔫籽粒的平均光譜反射率顯著高于其他3種,健康籽粒的光譜反射率值差異*大。霉變小麥籽粒受到**侵染的影響,籽粒表面顏色和形狀發(fā)生變化,但對含水率影響不大。因此,與萎蔫小麥籽粒相比,其光譜反射率值接近健康籽粒。萌發(fā)籽粒與健康籽粒不同,因?yàn)槠涿劝l(fā)需要消耗能量。但與其他兩種籽粒相比,其光譜反射率值*接近健康小麥籽粒。在1150 ~ 1300 nm和1400 ~ 1650 nm兩處波段的差異為后續(xù)分類算法的建立提供了基礎(chǔ)。

圖4 籽粒光譜。所有小麥籽粒的光譜(a);小麥籽粒在四種不同狀態(tài)下的平均光譜(b)。

對生成的光譜數(shù)據(jù)與真實(shí)光譜的相似度進(jìn)行評估。由表1可以看出,epoch從0增加到50時,生成數(shù)據(jù)與真實(shí)數(shù)據(jù)的RMSE呈斷崖式下降。雖然epoch為50時,RMSE已經(jīng)較?。?.064324),但是從5c和5h中可以看出生成的光譜大致輪廓與真實(shí)光譜相似,但存在較大噪聲。1000、1500、2000次epoch下的生成光譜曲線越來越接近真實(shí)光譜,噪聲逐漸降低,直到2000次epoch下生成的光譜噪聲基本消失。從圖6可以看出,無論迭代多少次,生成光譜的PC1和PC2均包含在真實(shí)光譜中,并且無法將兩者區(qū)分開來。這也說明了DCGAN生成的光譜與實(shí)際光譜的相似性。隨著epoch次數(shù)的增加,PC1和PC2的分布范圍逐漸變寬,直到在2000個epoch時達(dá)到*大。部分生成的光譜主成分的分布范圍超過了真實(shí)光譜。*后,綜合考慮多種評價指標(biāo),選取經(jīng)過2000次epoch后訓(xùn)練生成的光譜作為后續(xù)實(shí)驗(yàn)所需的樣本。

表1 不同epoch下小麥籽粒實(shí)測數(shù)據(jù)與生成數(shù)據(jù)的均方根誤差

圖5 不同epoch下的生成光譜數(shù)據(jù)和真實(shí)光譜數(shù)據(jù)的可視化

圖6 500、1500、2000次epoch下生成的光譜數(shù)據(jù)的主成分降維圖

表4給出了分類器在原始數(shù)據(jù)集和平衡數(shù)據(jù)集上的對比實(shí)驗(yàn)結(jié)果。數(shù)據(jù)平衡后,所有分類器的測試集的準(zhǔn)確率都得到了提高。其中,準(zhǔn)確率提高幅度*小的分類器是CNN模型,準(zhǔn)確率提高了8.34%。提升*大的是DT模型。準(zhǔn)確率從51.67%提高到80.83%,這也表明分類器受樣本是否平衡的影響明顯。從圖7可以看出,數(shù)據(jù)擴(kuò)展后,每個類別的誤分類次數(shù)都在減少。雖然這三種分類器從增加的數(shù)據(jù)樣本中學(xué)習(xí)到了更多的特征,準(zhǔn)確率也有了很大的提高,但*終測試集的準(zhǔn)確率仍然不能令人滿意。此外,CNN模型還存在過擬合的風(fēng)險,其訓(xùn)練集準(zhǔn)確率與測試集準(zhǔn)確率相差超過3%。這可能是由于訓(xùn)練樣本較少,CNN模型無法學(xué)習(xí)到更深層的特征,導(dǎo)致過擬合。因此,需要更多的樣本來提高分類器的識別能力。

表2 不同分類器對原始數(shù)據(jù)集和平衡數(shù)據(jù)集的分類精度

圖7 三種分類器在不平衡數(shù)據(jù)集(a)和平衡數(shù)據(jù)集(b)上分類結(jié)果的混淆矩陣

從表3和圖8可以看出,隨著加入訓(xùn)練集樣本數(shù)量的不斷增加,SVM、DT、CNN模型的性能變化是不同的。在每種小麥籽粒的訓(xùn)練集數(shù)據(jù)中加入50個樣本,SVM模型的測試集準(zhǔn)確率從75%提高到80%。然后,當(dāng)訓(xùn)練樣本數(shù)量增加200個時,SVM模型的分類準(zhǔn)確率*高,達(dá)到85.83%。隨著樣品的不斷加入,其準(zhǔn)確度在80% - 85%之間波動。這表明SVM仍然從這些增量樣本中學(xué)習(xí)到一些特征,但學(xué)習(xí)到的特征相對有限。DT模型的準(zhǔn)確率雖然也有所提高,但提高幅度較小,其準(zhǔn)確率一直在80%到85%之間波動。這表明DT模型從生成樣本中獲得的收益很小。對于CNN模型,隨著樣本數(shù)量的增加,其準(zhǔn)確率從79.17%提高到96.67%,總計(jì)提高了17.50%。之后,它的測試集準(zhǔn)確率開始在95%左右振蕩,并沒有隨著訓(xùn)練樣本的增加而增加。這可能是由于DCGAN在生成樣本時,作為其近似目標(biāo)的真實(shí)樣本數(shù)量相對較少。因此,雖然選擇了相似性和多樣性*好的生成樣本,但與現(xiàn)實(shí)世界中的真實(shí)樣本相比,其多樣性仍然比較一般。然而,與SVM和DT兩種機(jī)器學(xué)習(xí)模型相比,CNN具有更強(qiáng)的數(shù)據(jù)擬合能力和分類能力。隨著樣本數(shù)量的增加,它可以學(xué)習(xí)到更多的特征。

結(jié)合以上兩階段的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,基于DCGAN的數(shù)據(jù)增強(qiáng)模型能夠?yàn)椴黄胶鈹?shù)據(jù)集生成可靠的數(shù)據(jù)樣本,從而幫助分類任務(wù)。此外,在DCGAN的幫助下,SVM、DT和CNN模型的識別能力都得到了提升,其中CNN的提升效果*為顯著。這也表明基于DCGAN的數(shù)據(jù)增強(qiáng)模型對于樣本較少的數(shù)據(jù)集具有擴(kuò)展樣本的能力。以上研究為數(shù)據(jù)集不平衡或數(shù)據(jù)集有限條件下的高精度分類提供技術(shù)支撐。

表3 不同分類器在加入不同樣本數(shù)的測試集上的準(zhǔn)確率

圖8 不同分類器的分類精度隨訓(xùn)練集數(shù)據(jù)的增加而變化

作者信息

吉海彥,博士,中國農(nóng)業(yè)大學(xué)信息與電氣工程學(xué)院教授,博士生導(dǎo)師。

主要研究方向:高光譜成像技術(shù)及其農(nóng)業(yè)應(yīng)用研究、近紅外光譜分析技術(shù)及其應(yīng)用研究、農(nóng)業(yè)生物信息檢測與處理。

參考文獻(xiàn)

Li, H., Zhang, L., Sun, H., Rao, Z.H., & Ji, H.Y. (2022). Discrimination of unsound wheat kernels based on deep convolutional generative adversarial network and near-infrared hyperspectral imaging technology. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 268, 120722.

https://doi.org/10.1016/j.saa.2021.120722

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